Relatório Técnico HyInv
O dobramento inverso projeta sequências de aminoácidos para uma determinada estrutura proteica, e a triagem precisa de muitos candidatos que sejam diversos e bem dobrados.
Pontos-chave
- Em foco: O dobramento inverso projeta sequências de aminoácidos para uma determinada estrutura proteica, e a triagem precisa de muitos candidatos que sejam
- Detalhe: Resultado ainda sem revisão por pares
- Leitura editorial: resultado provisório, ainda sem revisão por pares formal.
Tanto indivíduos como organizações que trabalham com arXivLabs abraçaram e aceitaram nossos valores de abertura, comunidade, excelência e privacidade dos dados do usuário. ArXiv está comprometido com esses valores e só trabalha com parceiros que os aderem.
Tem uma ideia de um projeto que agregue valor à comunidade arXiv? . Saiba mais sobre o arXivLabs.
Resumo: O dobramento inverso projeta sequências de aminoácidos para uma determinada estrutura proteica, e a triagem precisa de muitos candidatos que sejam diversos e bem dobrados. Na inferência, um amostrador agrupado de rascunho e reescrita que usa temperaturas separadas de rascunho e reescrita melhora a pontuação TM de redobramento na diversidade correspondente.
Em cinco conjuntos de dados de referência e sete combinações de conjunto de dados-preditor, HyInv atinge um scTM médio mais alto do que todas as dez linhas de base externas com diversidade de sequência comparável ou superior, com grandes margens sobre ProteinMPNN e ProteinZero. A mesma configuração padrão suporta backbones de novo, bibliotecas com restrições de bolso, redesenho de enzima com o sítio catalítico mantido e redesenho de loop.
Fonte original: arXiv Quantitative Biology