A rotulagem com luz azul revela parceiros proteicos inesperados de estruturas dobradas de DNA

O DNA pode ser mais do que apenas uma dupla hélice. Quando quatro fios são dobrados em um feixe compacto, eles formam um G-quadruplex.

Quando quatro fios são dobrados em um feixe compacto, eles formam um G-quadruplex (G4). É por isso que compreender as interações em torno do G4 é tão importante.

A técnica também revelou que a hexoquinase-1 é um participante inesperado nessas interações. O problema é que identificar as proteínas que se ligam ao G4 não é nada simples”, explica Sato.

As sondas químicas mais recentes também têm desvantagens, pois ligam-se ao quádruplo e bloqueiam algumas das proteínas que deveriam capturar. O novo método sinalizou mais de 1.000 fichários candidatos, mas aquele que ficou em primeiro lugar foi inesperado.

Era a hexoquinase-1 (HK1), uma enzima que realiza a primeira etapa do metabolismo da glicose e normalmente atua na membrana externa das mitocôndrias. HK1 é uma enzima metabólica clássica geralmente associada à glicólise e, até onde sabemos, nenhuma interação direta com um ácido nucleico dobrado havia sido relatada antes. " A ligação foi confirmada com proteína purificada por dois ensaios independentes.

Ensaios de mudança de mobilidade eletroforética mostraram que HK1 forma um complexo com DNA de G4, mas não com DNA de fita dupla, e a termoforese em microescala confirmou que a interação é estreita.

Fonte